Wszystkie elementy systemu mają być zoptymalizowane pod kątem jak największej tolerancji dla wszelkiego rodzaju błędów. Ma zostać opracowany również nowy system plików, który przechowywałby informacje o sposobie interpretacji danych w plikach.
Minix ma być kompatybilny z systemami z rodziny uniksowej. Jego jądro ma być jak najmniejsze, by uniknąć pomyłek związanych z jego projektowaniem. Jądro systemu Minix 3 (tzw. mikrojądro) zawiera tylko 5 tys. linii kodu. Dla porównania: jądro Visty to niespełna 70 milionów linii kodu. Dzięki takim koncepcjom mają być zwiększone bezpieczeństwo oraz stabilność systemu.
Przyznane środki w wysokości 2,5 mln euro mają wystarczyć na finansowanie rozwoju oprogramowania przynajmniej do 2014 roku. Koncepcyjny prototyp nowego systemu oraz wszystkie jego komponenty mają zostać udostępnione na zasadach open source.