Nowa wersja zawiera ponad 20 zmian i poprawek. Ważnym dodatkiem jest możliwość zaawansowanego rozszerzania funkcjonalności programu serwerowego przy zastosowaniu skryptów. Rozwiązanie takie działa podobnie jak mechanizmy obsługi skryptów wbudowane w przeglądarki internetowe. Uruchomione pod kontrolą programu FBS Server skrypty mogą zmieniać zachowanie samego programu, jak i operować na elementach systemu operacyjnego, takich jak: system plików, rejestr czy rozszerzenia WMI. Program wyposażono w zintegrowane środowisko programistyczne (IDE) do edycji i testowania kodu. FBS Server obsługuje wszystkie języki skryptowe zgodne z technologią Microsoft ActiveX Scripting, m. in.: Java Script, VBScript i PHP Script.
Kolejną ważną nowością, która pojawiła się w wersji 3.3, jest możliwość bezpośredniego przywracania danych na stację roboczą. Przywracanie odbywa się poprzez wewnętrzny kanał komunikacyjny między serwerem a klientem z wykorzystaniem protokołu TCP/IP. Dzięki temu, że dane są przywracane lokalnie przez oprogramowanie klienckie, możliwe jest przywrócenie nawet takich plików, które są aktualnie używane. W ten sposób można przywrócić nie tylko dane użytkownika, ale i uruchomione programy lub składniki systemu operacyjnego.
Zmiany, o których również warto wspomnieć, to zwiększona szybkość uruchamiania konsoli serwera, wyszukiwarka plików w archiwach, nowy raport podsumowujący zadania archiwizacji, czy też nowy panel do zarządzania zasobami sieciowymi. Pozostałe zmiany podnoszą komfort pracy i eliminują błędy znane z wcześniejszych wersji programu.